市政府机构
| （1） 启东市人民政府办公室 | 简称：市政府办公室 |
| （挂牌：启东市人民政府研究室） | 简称：市政府研究室 |
| （挂牌：启东市人民政府外事办公室） | 简称：市外办 |
| （中共启东市委外事工作委员会办公室设在市政府办公室） | 简称：市委外办 |
| （2） 启东市发展和改革委员会 | 简称：市发展改革委 |
| （挂牌：启东市工业和信息化局） | 简称：市工业和信息化局 |
| （挂牌：启东市粮食和物资储备局） | 简称：市粮食和储备局 |
| （3） 启东市教育体育局 | 简称：市教育体育局 |
| （合署：中共启东市委教育工作委员会） | 简称：市委教育工委 |
| （启东市政府教育督导室设在市教育体育局） | 简称：市教育督导室 |
| （4） 启东市科学技术局 | 简称：市科技局 |
| （5） 启东市公安局 | 简称：市公安局 |
| （6） 启东市民政局 | 简称：市民政局 |
| （7） 启东市司法局 | 简称：市司法局 |
| （中共启东市委全面依法治市委员会办公室设在市司法局） | 简称：市委依法治市办 |
| （8） 启东市财政局 | 简称：市财政局 |
| （挂牌：启东市政府国有资产监督管理办公室） | 简称：市国资办 |
| （9） 启东市人力资源和社会保障局 | 简称：市人力资源社会保障局 |
| （10） 启东市自然资源局 | 简称：市自然资源局 |
| （挂牌：启东市林业局） | 简称：市林业局 |
| （挂牌：启东市海洋局） | 简称：市海洋局 |
| （11） 启东市住房和城乡建设局 | 简称：市住房城乡建设局 |
| （挂牌：启东市人民防空办公室） | 简称：市人防办 |
| （挂牌：启东市地震局） | 简称：市地震局 |
| （12） 启东市城市管理局 | 简称：市城市管理局 |
| （挂牌：启东市综合行政执法局） | 简称：市综合执法局 |
| （13） 启东市交通运输局 | 简称：市交通运输局 |
| （14） 启东市水务局 | 简称：市水务局 |
| （15） 启东市农业农村局 | 简称：市农业农村局 |
| （挂牌：启东市政府扶贫工作办公室） | 简称：市扶贫办 |
| （中共启东市委农村工作领导小组办公室设在市农业农村局） | 简称：市委农村工作领导小组办公室 |
| （16） 启东市商务局 | 简称：市商务局 |
| （挂牌：启东市口岸办公室） | 简称：市口岸办 |
| （17） 启东市文化广电和旅游局 | 简称：市文广和旅游局 |
| （18） 启东市卫生健康委员会 | 简称：市卫生健康委 |
| （19） 启东市退役军人事务局 | 简称：市退役军人局 |
| （20） 启东市应急管理局 | 简称：市应急局 |
| （21） 启东市审计局 | 简称：市审计局 |
| （中共启东市委审计委员会办公室设在市审计局） | 简称：市委审计办 |
| （22） 启东市行政审批局 | 简称：市行政审批局 |
| （挂牌：启东市政务服务管理办公室） | 简称：市政务办 |
| （23） 启东市市场监督管理局 | 简称：市市场监管局 |
| （挂牌：启东市知识产权局） | 简称：市知识产权局 |
| （24） 启东市统计局 | 简称：市统计局 |
| （25） 启东市医疗保障局 | 简称：市医保局 |
| （26） 启东市信访局 | 简称：市信访局 |
| （合署：中共启东市委信访局） | 简称：市委信访局 |
| （27） 启东市地方金融监督管理局 | 简称：市地方金融监管局 |
| （挂牌：启东市人民政府金融工作办公室） | 简称：市金融办 |